Način i mjerila povezivanja muzeja u sustav muzeja utvrđena su Pravilnikom.
Muzeji se povezuju prema vrsti građe na dvije razine: za područje cijele države te za određeno područje.
Sustav muzeja sačinjava 140 hrvatskih muzeja s 1013 muzejskih zbirki, u kojima se nalazi oko 10 milijuna predmeta, o kojima skrbi 750 stručnih djelatnika.
Cilj matične djelatnosti je poboljšanje kvalitete djelovanja muzeja uspostavljanjem jedinstvenih standarda i normi za obavljanje muzejskih djelatnosti.
Poslovi koje matična djelatnost obuhvaća su: stručni nadzor nad radom muzeja, stručna pomoć, unaprjeđenje stručnog rada i usklađivanje rada unutar Sustava muzeja.
Zadaće novoutemeljenog Vijeća Sustava muzeja bit će promicanje ravnomjerne rasprostranjenosti muzeja, ustrojavanje razvojnih programa, promicanje mjera zaštite muzejske građe i muzejske dokumentacije te ustroj središnjih (regionalnih) čuvaonica, priopćeno je iz Muzejskoga dokumentacijskog centra u Zagrebu.