Pretrpio je, između ostalog, dva lakša moždana udara..
Suharto, kojega je organizacija Transparency International proglasila najkorumpiranijim čelnikom na svijetu, krivično je gonjen zbog otuđivanja novčanih sredstava 2000. godine.
Sudski je postupak odgođen jer su liječnici ocijenili da mu zdravstveno stanje ne dozvoljava da se brani.