Ukoliko bude proglašen krivim, može biti osuđen na zatvorsku kaznu do sedam godina, novčanu kaznu do 200 tisuća eura ili kombinaciju tih kazni.
Optužnica ga tereti za prijetnje, zastrašivanje i nuđenje mita potencijalnim svjedocima optužbe u predmetu "Limaj i drugi", gdje je među trojicom optuženih i njegov rođak Isak Musliu.
"Od 17. veljače 2003. do 19. listopada 2004. Beqaj je, sam ili u dogovoru s drugima, prijetio svjedocima, zastrašivao ih, nudio im mito i na druge načine utjecao na svjedoke ili potencijalne svjedoke..." u predmetu Limaj i drugi, stoji u optužnici.
U optužnici se opisuje postupanje optuženog prema svjedocima Rexhe Raxhaju i Rizahu Rexahju, koji su dali iskaze protiv Musliua.
Navodi se kako je, postupajući po izravnim uputama Musliua i Limaja iz pritvora, u više navrata izravno ili preko posrednika zahtijevao od te dvojice svjedoka da povuku iskaze, prijeteći im ali i nudeći zemljišne parcele za nagradu.
Glavna tužiteljica Carla del Ponte optužnicu protiv 52-godišnjeg Beqaja podigla je 21. listopada, a sudac Carmel Agius potvrdio ju je 29. listopada. Zapečaćena je ostala do uhićenja optuženog i njegovog prebacivanja u Haag, a objavljena je prošloga petka.
Suđenje za ratne zločine nad zatočenicima logora OVK-a Lapušnik, koji su vodili Limaj, Musliu i Haradin Bala, prvi proces kosovskim Albancima pred ICTY-em, treba početi 15. studenoga.
Tereti ih se za kršenje ratnog prava i običaja zbog ubojstva 20-ak srpskih i albanskih civila te nezakonito pritvaranje i mučenje Srba i albanskih kolaboracionista u logoru OVK u Lapušniku godine 1998.
Del Ponte se u izviješću Europskoj uniji 11. listopada i NATO-u 3. studenoga požalila da se Tužiteljstvo na Kosovu susreće s organiziranom i sustavnom kampanjom zastrašivanja svjedoka.
Trojici optuženih Kosovara ICTY je prošloga mjeseca ograničio komunikaciju iz pritvora na članove obitelji i branitelje, a glavni tužitelj u predmetu Andrew Caley najavio je da će tijekom suđenja izvoditi i dokaze o zastrašivanja svjedoka optužbe na Kosovu.