Teolog po obrazovanju, Banana je desetak godina nakon silaska s vlasti pao u nemilost zbog optužbi za homoseksualnost, koja je u Zimbabveu kažnjiva.
Godine 1999. ga je Vrhovni sud osudio na deset godina zatvora zbog optužbe da je seksualno zlostavljao svog tjelesnog čuvara.
Canaan Banana je imao odlučujuću ulogu u borbi protiv vlasti bijelaca na čelu tadašnje Rodezije te je morao otići u progonstvo u Sjedinjene Države krajem 60-ih godina kako ne bi bio uhićen.
Njegova žena Janet, od koje se rastao, tražila je 2000. azil u Velikoj Britaniji.