Al-Zubaydi je najviši pritvoreni vojni zapovjednik do sada, a detalji njegova uhićenja nisu objavljeni.
On je obnašao i dužnosti premijera i zamjenika premijera, a američki State Department optužio ga je za zločine protiv čovječnosti, navodeći da je nasilno ugušio ustanak šijita u južnom Iraku, nakon Zaljevskog rata 1991. Vjeruje se da su tada ubijeni deseci tisuća ljudi.
Iako i sam šijit, 58-godišnji al-Zubaydi prikazivan je u iračkim vijestima kako tuče šijitske disidente i nadgleda isušavanje močvara u šijitskom području južnog Iraka, koje je, po tvrdnjama grupa za zaštitu prirode, izazvalo prirodnu katastrofu.